La cartera de patentes de PharmaMar está constituida por más de 1.800 expedientes, de los cuales alrededor de 1.200 son patentes concedidas y 600 son solicitudes de patente todavía en tramitación. Dichos expedientes se hallan reunidos en 100 familias de patentes, cada una de las cuales protege una invención determinada.
Un tercio de todas las patentes y publicaciones científicas acerca de fármacos anticancerígenos de origen marino son fruto de la investigación llevada a cabo por PharmaMar.